在细菌全基因组测序(WGS)实验中,磁珠DNA纯化是文库制备的核心环节。传统手工操作不仅耗时费力、易引入人为误差,还会限制样本通量与实验稳定性。如今,Hamilton Microlab PuriFY自动化纯化平台带来全新解决方案,适配NGS文库制备流程,大幅提升实验效率与测序质量!

一、痛点直击:手工纯化的诸多难题
下一代测序文库制备包含多步磁珠纯化流程,人工操作短板十分突出:
操作步骤繁琐,全程占用大量人力;
多批次样本处理时,人为失误概率飙升;
磁珠残留、操作不均等问题,间接影响下游测序结果;
吸头等耗材消耗量大,实验成本居高不下。
为破解以上问题,本次联合National Jewish Health开展对比实验,验证 Microlab PuriFY自动化纯化系统的应用价值。
二、实验方案:自动化VS手工,同台对比

实验选取7株细菌分离株,采用QIAgen试剂盒提取基因组DNA,搭配Quantabio sparQ系列试剂盒构建测序文库,分别设置手工纯化组与Microlab PuriFY自动化纯化组,每组设置重复样本与无模板对照(NTC)。
两组严格按照对应流程完成两轮磁珠纯化,从操作时长、耗材用量、核酸浓度纯度、文库片段、测序数据五大维度开展综合评估。
依托MagPore技术(双磁铁系统+正压驱动+专用纯化条),自动化系统可高效完成上清转移、多次洗涤、核酸重悬与洗脱收集,大幅简化流程。
三、硬核实测:多项数据优秀
三、硬核实测:多项数据优秀
1. 人力&耗材大减负,降本增效看得见
两轮纯化累计耗时对比:
手工操作:总计50分钟
Microlab PuriFY:总计16分钟
人工操作时长缩减3.1倍,科研人员从重复机械操作中解放。
耗材消耗对比:
手工操作:总计使用79支吸头
Microlab PuriFY:总计使用18支吸头
吸头用量减少4.4倍,有效降低实验耗材成本。
2. 文库质量稳定,片段完整性优异
通过Qubit、NanoDrop、Agilent TapeStation多重质控检测:
核酸纯度:两组260/280、260/230吸光比值均处于合格区间,纯度表现相当;

文库浓度:自动化组浓度均一性更强,数据波动更小;

片段长度:手工组平均357.4bp,自动化组平均393.7bp,文库完整性更佳,片段分布符合测序要求。

同时实验发现,手工流程易出现磁珠残留,而Microlab PuriFY全程无磁珠携带污染,规避了杂质对后续实验的干扰。平台还具备自动排障能力,遇到管路堵塞可自动加压疏通,实验容错率更高。
3. 测序表现跨越式提升,测序深度达标无忧
采用Illumina MiSeq开展上机测序,核心数据差距显著:
测序数据产量:自动化组数据产出约为手工组的3倍,读段数量大幅提升;
基因组覆盖深度:手工样本中位覆盖深度仅25~33×,自动化样本可达 65~73×,轻松突破传统方法瓶颈,稳定实现>40×的理想测序深度;
测序质量:两组Q30优质读占比基本持平,测序碱基可靠性均有保障。
充足的数据产出与更高的覆盖深度,让细菌基因组分析结果更精准、更全面。
四、平台核心优势,适配临床&科研实验室
操作简单易上手:程序编写、修改、运行门槛低,快速落地现有实验体系;
设备布局灵活:机身占地面积小,搭配定制化触控屏幕,适配各类实验室空间;
流程高度兼容:匹配主流NGS文库制备试剂盒,通用度广;
专业技术支持:原厂配套服务,保障实验稳定运行。
五、总结
从人力成本、耗材消耗,到文库质控、上机测序,Hamilton Microlab PuriFY自动化DNA纯化系统全面优于传统手工操作。它不仅解决了细菌全基因组测序文库纯化的人工痛点,更显著提升测序数据质量与实验重复性,是高通量NGS实验室提质增效的理想选择。
无论是基础科研、病原微生物检测,还是规模化样本测序项目,这款自动化平台都能为您的实验保驾护航!
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